Quand Charles Darwin s'embarque sur le HMS Beagle, le 27 décembre 1831, le naturaliste en herbe n'a pas encore 23 ans, et aucune idée de ce qui l'attend lors de ce périple long de cinq années sur les mers du globe. De découvertes humaines en indices scientifiques, Darwin apprend, déchante, s'émeut, se scandalise, et s'émerveille. Il accumule les notes et les idées qui l'amènent à transformer radicalement la vision de l'Humanité sur sa propre histoire, notamment en y incluant l'idée du temps long.
C'est à son retour, et tout au cours de sa vie, qu'il entreprend la rédaction de sa fameuse et controversée - encore aujourd'hui, dans certains pays particulièrement religieux - théorie sur l'évolution des espèces, théorie qui bouleversa définitivement la science de son temps pour lui survivre jusqu'aujourd'hui.
Cette exploration, longue, périlleuse et pénible souvent, est un voyage qui véritablement, en changeant un homme, changea le cours de la science.