Thierry Magnier a fondée en 1998 la maison d’édition qui porte son nom. Le logo, un petit ange lecteur, est une métaphore du lecteur : "Un ange, ça n’a pas de sexe, pas d’âge". La maison produit environ 75 titres par an. Le premier succès vient avec Tout un monde, un imagier de Katy Couprie et Antonin Louchard, "pari" éditorial réussi, est désormais édité dans de nombreux pays.
La création est toujours contemporaine et exigeante, avec une ligne politique et idéologique qui porte le respect du livre et de la lecture, de l’auteur et du lecteur.
En juillet 2005, les éditions Thierry Magnier intègrent le groupe Actes Sud.